Фильм переносит зрителей в 1954 год. В американском штате Массачусетс находится небольшой остров Шаттер, на котором размещена особая тюрьма для преступников с психическими заболеваниями. Когда в этой тюрьме таинственно исчезает одна пациентка, на остров отправляется два сотрудника полиции, чтобы провести расследование этого случая, ведь существуют подозрения что в этой клинике-тюрьме используют неэтичные и незаконные методы лечения. И когда они начали расследование и кажется наткнулись на что-то интересное начинается ураган, который отрезает их от суши, кроме этого в самой тюрьме начинается бунт самых опасных преступников, а сами следователи погружаются в обман со стороны администрации. Плюс ко всему этому главный герой Тедди Дэниелс начинает во всем сомневаться - в своей памяти, напарнику и даже в собственном уме.